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목록데이터 분석 (1)
KimbgAI
[medical] 유전역학-개론 6주차, 차세대 시퀀싱(NGS) 데이터 분석
지난 시간에 NGS에 대해 배웠다. NGS는 단지 시퀀싱하는 기술 그 자체이고, 이번에 알아야할 것은 시퀀싱한 그 정보를 어떻게 분석을 할것이냐 하는 것이다. chip array를 가지고 하던지, 생어시퀀서로 하던지, NGS로 하던지 간에 우리가 받는 데이터는 diplotype의 genotype data이다. 무엇을 하던간에 질환과의 연관분석을 하기 위해서는 이 genotype data를 가지고 살펴보면 된다. 그럼 NGS 분석이라는 것은 무엇이냐? 연관분석을 하기 전의 '데이터 전처리' 단계라고 생각하면 된다. DNA조각들을 가지고 시퀀싱을 하게 되면, 우리가 알고있는건 단지 그 DNA 조각들(read)의 정보 뿐이다. 이것들을 통합하고 분석하는 과정이 필요하다. chip array 데이터는 이렇게 복..
medical
2023. 4. 12. 12:43