반응형
Notice
Recent Posts
Recent Comments
Link
일 | 월 | 화 | 수 | 목 | 금 | 토 |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | |||||
3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 |
17 | 18 | 19 | 20 | 21 | 22 | 23 |
24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | 30 |
Tags
- TeCNO
- Phase recognition
- words encoding
- PYTHON
- paper review
- deep learning #segmentation #sementic #pytorch #UNETR #transformer #UNET #3D #3D medical image
- MRI
- monai
- 모수적 모델
- 파이썬
- nibabel
- tabular
- 비모수적 모델
- MICCAI
- non-parametric model
- parrec
- 코드오류
- parametric model
- precision #정밀도 #민감도 #sensitivity #특이도 #specifisity #F1 score #dice score #confusion matrix #recall #PR-AUC #ROC-AUC #PR curve #ROC curve #NPV #PPV
- 유전역학
- Surgical video analysis
- parer review
- nfiti
- 확산강조영상
- TabNet
- decorater
- genetic epidemiology
- nlp
- 데코레이터
- 확산텐서영상
Archives
- Today
- Total
목록ngs (1)
KimbgAI
[medical] 유전역학-개론 6주차, 차세대 시퀀싱(NGS) 데이터 분석
지난 시간에 NGS에 대해 배웠다. NGS는 단지 시퀀싱하는 기술 그 자체이고, 이번에 알아야할 것은 시퀀싱한 그 정보를 어떻게 분석을 할것이냐 하는 것이다. chip array를 가지고 하던지, 생어시퀀서로 하던지, NGS로 하던지 간에 우리가 받는 데이터는 diplotype의 genotype data이다. 무엇을 하던간에 질환과의 연관분석을 하기 위해서는 이 genotype data를 가지고 살펴보면 된다. 그럼 NGS 분석이라는 것은 무엇이냐? 연관분석을 하기 전의 '데이터 전처리' 단계라고 생각하면 된다. DNA조각들을 가지고 시퀀싱을 하게 되면, 우리가 알고있는건 단지 그 DNA 조각들(read)의 정보 뿐이다. 이것들을 통합하고 분석하는 과정이 필요하다. chip array 데이터는 이렇게 복..
medical
2023. 4. 12. 12:43